記紀では、崇神天皇が即位して９年、大和国内には疫病が蔓延し、多くの人々が死に絶えようとしていた事を、大いに歎き悲しんだとあります。同9年３月１５日のある夜には、天皇の夢のなかに神人が現われて、「赤盾八枚・赤矛八竿(さお)を以て、墨坂神(すみさかのかみ)を祠れ。亦(また)黒盾八枚・黒矛八竿を以て、大坂神(おおさかのかみ)を祠れ。」と告げたのです。天皇は、さっそく墨坂神と大坂神に盾と矛を奉献（貢物）し、祀ったところ、疫病や災いが無くなり国内がやすらかになりました。 その後、天皇は近畿とその周辺までその勢力範囲を広げ国を治めることとなったので大和朝廷を確立した最初の天皇と考えられ、御肇国天皇(ハツクニシラススメラミコト)と褒め称えられることもなったのです。 墨坂神社の秋の大祭では、かつて伊勢街道の西峠付近の「天の森」に鎮座しておられたのを文安６年(1449年)９月２８日に現在の所に遷座した事から、お旅所から現在の社地までの約１kmの道のりを、猿田彦を先頭に武者、赤盾・赤矛・太刀などを持ち還幸の神輿行列が華やかに神社に渡ります。